中国临床药理学与治疗学 ›› 2020, Vol. 25 ›› Issue (12): 1351-1356.doi: 10.12092/j.issn.1009-2501.2020.12.005
刘建辉1，周根鸿1，李春林1，鲍美华2，刘方怡2
LIU Jianhui 1, ZHOU Genhong 1, LI Chunlin 1, BAO Meihua 2, LIU Fangyi 2
摘要： 目的：利用生物信息学手段，分析筛选骨髓增生异常综合征（myelodysplastic syndromes, MDS）相关的长链非编码RNA（long noncoding RNA, lncRNA），并预测其功能。方法：利用基因表达汇编（Gene Expression Omnibus, GEO）中的GEO2R工具，筛选数据集GSE145733中与MDS相关的差异表达lncRNA。利用miRDB网络分析平台和Cytoscape软件，分析与差异表达lncRNA关联的微小RNA（microRNA, miRNA）和信使RNA（mRNA），构建lncRNA-miRNA-mRNA关系网络。并利用GO基因功能注释和KEGG通路富集分析，预测这些lncRNA的功能。结果：经差异分析后，筛选出5个在骨髓增生异常综合征患者中显著降低的lncRNA。这五种lncRNA主要与19种miRNA和84种mRNA显著关联。主要影响MDS相关的物质合成与转运、基因转录等生物学过程，并与神经系统功能密切相关。 结论：本研究揭示了MDS患者lncRNA的表达特征，并预测了其功能，结果将为MDS的精准治疗提供新靶点。
中图分类号:
